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日本公开流感病毒蛋白立体构造预测数据

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日期:2006-11-30 来源:景天阁·健康资讯
内容提示: 从1月20日起,世界各地的研究人员都可以在日本理化研究所的网站上,浏览流感病毒表面蛋白神经氨酸酶1500多个种类的立体构造预测数据。神经氨酸酶是流感病毒增殖不可缺少的蛋白质,也是许多抗流感药物攻击病毒的“靶子”。日本理化研究所的研究人员介绍说,他们从美国收集的组成蛋白质的氨基酸序列数据库中调取...

从1月20日起,世界各地的研究人员都可以在日本理化研究所的网站上,浏览流感病毒表面蛋白神经氨酸酶1500多个种类的立体构造预测数据。

神经氨酸酶是流感病毒增殖不可缺少的蛋白质,也是许多抗流感药物攻击病毒的“靶子”。著名的抗流感药达菲就是通过阻碍神经氨酸酶的活性而发挥作用的。神经氨酸酶大体分为N1至N9共9大类,但是根据其氨基酸序列的微小差异可以进一步细分为1603个种类,其中能够感染人类的N1型和N2型约占80%。

日本理化研究所的研究人员介绍说,他们从美国收集的组成蛋白质的氨基酸序列数据库中调取和神经氨酸酶相关的氨基酸序列数据,输入预测蛋白质立体构造的电脑软件。在参照利用X射线已经完成解析的约70种神经氨酸酶构造的基础上,研究人员预测出了剩余1500多种神经氨酸酶的立体构造。相关数据已被加工成数据库,刊登在理化研究所的网站上。

以往利用X射线解析蛋白质立体构造,平均解析一种就要耗时3个月以上。而利用理化研究所开发的软件,只要掌握氨基酸序列,平均90分钟就能预测一种神经氨酸酶的立体构造。

日本北里大学药学系教授、理化研究所特聘研究员梅山秀明说,“我们期待向全世界研究人员公开神经氨酸酶立体构造数据能促进新型治疗药物的开发,并缩短开发时间。”梅山秀明说,一旦禽流感病毒变异成能在人际传播的新型流感病毒,理化研究所的数据将有助于研究人员迅速开发出针锋相对的治疗药物。

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