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苏北地区2003年病毒性脑膜炎爆发病原分离株Echo30的序列分析

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日期:2006-11-21 来源:景天阁·健康资讯
内容提示:282-2857(上海)为了测定2003年苏北地区无菌性脑膜炎爆发的病毒分离株部分基因序列,了解该流行株的分子生物学特点及遗传变异规律,研究者随机选取3株分离的病毒株,用能特异性扩增..

2005年10月08日中华流行病学杂志2005Vol.26No.4p.282-2857 (上海)为了测定2003年苏北地区无菌性脑膜炎爆发的病毒分离株部分基因序列,了解该流行株的分子生物学特点及遗传变异规律,研究者随机选取3株分离的病毒株,用能特异性扩增肠道病毒Vp1区3'段序列的两对引物012/011、040/011进行逆转录聚合酶链反应,扩增产物经凝胶纯化后测序。将序列输入GenBank用BLAST程序进行核苷酸和氨基酸序列比对;选取部分肠道病毒序列,经CLUSTALX1.83对齐后,在pHYLIp3.5c中构建进化树,了解分离毒株Echo30的进化关系。结果3株病毒测序结果均为Echo30型肠道病毒。进化树分析显示分离的Echo30毒株与国外1999年和2000年分离株的亲缘关系最近;但3株分离株自成一簇,与国外毒株存在地区差别。可见利用Vp1区3'段序列可以快速正确区分肠道病毒分离株的型别,分离株与国外同型流行株在比较区段的遗传变异规律类似。

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