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结直肠癌的基因表达

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日期:2006-11-21 来源:景天阁·健康资讯
内容提示:据丹麦学者报道,结直肠癌(CRC)基因及其表达序列标记(EST)的改变成为防治CRC的最新靶点。丹麦Aarhus大学分子诊断学实验室的Karin Birkenkamp-Demtroder博士指出,定义新的生物学标志物和治疗目的时,需要了解结直肠癌(CRC)的分子改变。为此,研究人员利用寡核苷酸芯片,监测左侧散发结直肠癌的全部RNA的5个池(每个..

据丹麦学者报道,结直肠癌(CRC)基因及其表达序列标记(EST)的改变成为防治CRC的最新靶点。

丹麦Aarhus大学分子诊断学实验室的KarinBirkenkamp-Demtroder博士指出,定义新的生物学标志物和治疗目的时,需要了解结直肠癌(CRC)的分子改变。为此,研究人员利用寡核苷酸芯片,监测左侧散发结直肠癌的全部RNA的5个池(每个池含4至6个样本)中的6,800个已知基因和35,000个表达序列标记(EST)的基因表达。

研究人员比较了正常组织和Duke分期A-D期(无浸润至远端转移)的肿瘤组织,并识别了由正常发展至肿瘤组织时变化显著的908个已知基因和4,155个EST。结果发现,通过强化滤除,226个已知基因和157个EST与CRC高度相关。

对25个单独样本进行阵列分析发现,>70%的病例证实了已知基因的变化。双向分层平均连接簇分析分别将DukeA期与正常组织集簇、DukeB期与DukeC期集簇、DukeD期集簇。10个已知基因和5个EST的实时pCR显示,基于阵列的发现具有良好的重复性。改变频率最高的基因位于代谢(22%)、转录与翻译(11%)和细胞处理(9%)功能区。CRC时,15个核编码的线粒体蛋白全部发生降调节。

研究人员识别了具有可能癌基因或肿瘤抑制基因簇的多个染色体区域。其中一些,例如15q25染色体上的氨肽酶N/CD13和sigmaB3蛋白,与频发杂合子丢失相一致。

Birkenkamp-Demtroder博士认为,该研究发现的基因和EST能够编码新的可能肿瘤标志物,并可成为防治CRC的新治疗目标。

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